Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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