Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A1-202ENST00000339868 5678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC22-201ENST00000319374 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG2-204ENST00000357544 4678 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR370-201ENST00000362135 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU105C-201ENST00000362342 209 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP349-201ENST00000363743 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA71E-201ENST00000365032 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-27-201ENST00000390304 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355574.1-201ENST00000423793 311 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108868.1-201ENST00000431411 554 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233724.2-201ENST00000515727 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BRWD1P2-201ENST00000546823 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005871.2-201ENST00000549104 526 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3125-201ENST00000579927 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005088.1-201ENST00000621922 274 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LHX4-201ENST00000263726 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOCD1-202ENST00000360482 3960 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC5-222ENST00000535622 5155 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CHAMP1-201ENST00000361283 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN29-204ENST00000562072 2345 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHM1P1-204ENST00000582201 3166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR3-202ENST00000370243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms