Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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