Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms