Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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