Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC61Q9Y6R9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms