Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUBP2Q9Y5Y2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUBP2Q9Y5Y2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms