Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms