Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms