Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD2APQ9Y5K6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms