Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF330Q9Y3S2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms