Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2J1Q9Y385 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms