Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAN1Q9Y2M0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms