Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCE1Q9Y256 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms