Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC5Q9UQL6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms