Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms