Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS5Q9UPZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms