Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms