Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms