Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CROTQ9UKG9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms