Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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