Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA1Q9UIW2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms