Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms