Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN8Q9UBY8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms