Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms