Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHRF1Q9P1Y6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms