Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms