Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms