Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms