Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms