Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30AQ9NV96 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30AQ9NV96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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