Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms