Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms