Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN4Q9NQC3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4Q9NQC3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms