Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LHX9Q9NQ69 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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