Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPAG4Q9NPE6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms