Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM3Q9NNZ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM3Q9NNZ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms