Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms