Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH6AQ9H0K4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms