Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRINP2Q9C0B6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms