Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms