Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRCC1Q9C099 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms