Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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