Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRNKL1Q9BZJ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms