Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms