Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms