Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms