Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM43Q9BTV4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms