Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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