Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC22CQ9BRL7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms